國家“863計(jì)劃”現(xiàn)代農(nóng)業(yè)技術(shù)領(lǐng)域在動植物功能基因組研究方面，利用“十五”建立的水稻功能基因組技術(shù)平臺，系統(tǒng)開展了水稻產(chǎn)量、品質(zhì)、抗病抗逆、營養(yǎng)高效性狀的功能基因組研究，克隆驗(yàn)證了一批具有重要應(yīng)用價(jià)值的新基因和調(diào)控因子；應(yīng)用芯片技術(shù)建立了水稻重要農(nóng)藝性狀的全基因組表達(dá)譜；開展了比較基因組學(xué)研究，同時(shí)開展了第3、4染色體功能基因突變體的收集和系統(tǒng)鑒定；開展了小麥、玉米、棉花、油菜、大豆、花生、番茄等作物的功能基因組研究技術(shù)平臺的構(gòu)建，對重要農(nóng)藝性狀相關(guān)基因進(jìn)行克隆驗(yàn)證；建立了家蠶和家雞的功能基因組研究技術(shù)平臺，分離克隆了與家蠶絲蛋白質(zhì)合成、性別決定、發(fā)育變態(tài)、分子免疫相關(guān)以及與雞的生長、品質(zhì)、抗性、繁殖等重要經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)的功能基因和調(diào)控因子。

在水稻、家蠶功能基因平臺建設(shè)和主要動植物功能基因發(fā)掘利用方面取得顯著的進(jìn)展，為主要動植物的遺傳改良和新品種的培育提供了大量有利用價(jià)值的基因資源和分子育種材料。

申請國家發(fā)明專利54項(xiàng)，獲得專利授權(quán)17項(xiàng)；發(fā)表研究論文190篇，其中SCI收錄122篇；克隆新基因200多個；申報(bào)軟件著作權(quán)2項(xiàng)；培育和審定具有產(chǎn)業(yè)化前景的新品種9個，與企業(yè)合作產(chǎn)品研發(fā)3項(xiàng)；建立示范與產(chǎn)業(yè)化基地4個；培養(yǎng)研究生193人，其中博士96人。